Главната образователна дейност на Регионален исторически музей – Кюстендил от февруари 2015 г. насам обхваща 14 тематични области, които се представят под формата на музейни работилници. От тях са обособени две основни образователни програми – „Култура и изкуство в древността” и „История и традиции“. Първата е насочена към запознаване с различни артефакти, експонирани в музейното изложбено пространство, и с техните послания за живота на хората в миналото. Втората се занимава с важни исторически събития от националната и местната история и с изучаването на техники и практики от традиционни занаяти.   

Програмите се реализират в два модула – практичен и теоретичен. Практичният включва детски ателиета за изработване на предмети по съответната тема. Теоретичният, осъществяван успоредно, се състои в представяне на образователна информация чрез дигитални презентации и печатни учебни помагала. Заниманията се провеждат всеки месец и са посветени на събитие от местно и национално значение, което се е случило или се случва в него.  

Целеви групи:

Деца в предучилищна възраст (5-6 години);

Деца в начална училищна възраст (7-10 години);

Деца в прогимназиална училищна възраст (11-13 години).